灵芝是一种腐生性的真菌，其生长、繁殖等生理活动过程中所需的营养、能量等皆来自其菌丝体生存的基质中。但是在灵芝菌丝体生长（亦称营养生长）期与其子实体生长（亦称繁殖生长）期对营养成分的需要量及种类、各种营养之间的比例等均不同。
（一）菌丝体生长期所需的营养及其代谢
1.碳源
灵芝的菌丝生长在基质中，在自然界是在朽木中生长，菌丝生长过程中所需要的各种营养，都是从朽木中吸收的。由于菌丝的细胞壁较厚，限制了菌丝的生长，仅仅是各个分枝的顶端部分的细胞壁较薄，细胞质多，代谢活动旺盛，是生长最集中的地方。从基质中吸收营养的过程也主要集中在菌丝的顶部分。碳源则是它吸收的主要营养成分之一。
来自朽木的碳源主要是葡聚糖类、有机酸、果胶、淀粉、纤维素、半纤维素及木质素等含碳较多的有机化合物。灵芝对朽木中纤维素、半纤维素的利用差，如果无其它条件影响，灵芝的菌丝只能利用木质素及其它小分子的碳水化合物。
由于灵芝只利用朽木中的木质素，留下了纤维素和半纤维素，使朽木呈现出白色的腐朽现象，故在森林病理学中将其划归在白腐菌类之中。
灵芝菌丝对含碳的无机化合物，如二氧化碳、碳酸盐类以及碳元素是不能吸收利用的。在可以利用的有机碳化合物中，能够最先被直接吸收的碳源有单糖类（包括左旋葡聚糖的水解物）、有机酸及醇类。那些大分子的木质素、淀粉、果胶等营养物质，被灵芝菌丝向细胞外分泌出能水解木质素等的各种酶类，将其分解为小分子的单糖或双糖，如阿拉伯糖、木糖、半乳糖、果糖及葡萄糖等之后，才能被菌丝利用。
被吸收到菌丝内的单糖类及其它小分子碳水化合物中，约有20%的碳源被用来构成细胞内各种结构和合成含碳的各种化合物及蛋白质、氨基酸或肽类、脂类等，其余的80%是被菌丝内的各种酶类继续水解成水和二氧化碳，从中获得其生理活动中所需的能量。
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