灵芝不管是孢子还是子实体的化学成分都很复杂，特别是灵芝孢子具有双层壁较难打破，对其化学成分还需要进一步的深入研究。目前认为，灵芝化学成分组成大概可分为几类：
蛋白质和氨基酸类、糖肽类、维生素类、胡萝卜素、甾醇类、三萜类、生物碱类、脂肪酸类、
内酯和无机离子类等，其中多糖、三萜类化合物、核苷、生物碱等是灵芝的主要有效成分，对这几类主要有效成分，特别是多糖的分离提取、药理作用以及临床作用的研究已成为了热点。
破壁灵芝孢子粉多糖的研究
随着灵芝孢子壁被人们用有效的方法打破，对灵芝孢子粉的化学成分研究也不断展开。2006年黄晓兰等，研究了灵芝孢子粉多糖的组成、相对分子质量及相对分子质量分布，比较破壁与不破壁灵芝孢子粉多糖的异同，结果表明，不同提取方法所得灵芝孢子粉多糖的得率不同，破壁后灵芝孢子粉含的多糖是不破壁的1.7倍；灵芝孢子粉多糖是由鼠李糖、阿拉伯糖、甘露糖、葡萄糖和半乳糖组成的杂多糖，破壁与不破壁的多糖组成完全相同，其相对质量分数略有区别；朱俊洁等采用破壁提取综合法将灵芝孢子破壁和有效成分提取结合起来, 经过一次加工处理在降低提取费用的同时提高了灵芝孢子多糖提取得率；刘英梅等2006年，通过正交试验法，优化了灵芝孢子粉中多糖提取的工艺过程，得出较为可行的孢子粉多糖提取最佳工艺。目前，用苯酚-硫酸法测定灵芝多糖是比较常用的方法，2005年朱建国等，用苯酚-硫酸法初步建立了灵芝孢子粉多糖含量测定的方法，得到测定中显色的最佳条件为：5%的苯酚1.6ml，浓硫酸8ml，温度为20℃，反应时间为24min。2006年白在贤等采用硫酸葸酮比色法测定破壁灵芝孢子粉中多糖类含量，同时考察了该方法的专属性、准确性、精密性及线性关系。结果表明此法准确、可靠、重现性较好，可用于破壁灵芝孢子粉中多糖的含量测定。
破壁灵芝孢子粉其他化学成分的研究
除此之外，人们还发现灵芝孢子粉蛋白质含量高达18%，富含多种必需氨基酸和脂肪酸，维生素类主要是维生素E，含量超过600mg／kg，另外也含有少量的维生素C；并且不断在灵芝孢子粉中发现新的三萜类物质，2003年马林等还发现三萜类物质在灵芝子实体和孢子粉中的含量不同；灵芝孢子粉中的脂肪酸以不饱和脂肪酸油酸和亚油酸为主，也包含长链烯酸。其内酯类属五环三萜内酯，有灵芝孢子内酯A和B。生物碱类有胆碱、甜菜碱和硫组氨酸甲基内胺盐。灵芝孢子粉中微量元素钴(Co)、硒(Se)和铬(Cr)与人类的健康和疾病的防治有密切关系。
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